Kuddusi Müftüoğlu, 1970 yılında Alanya’da dünyaya geldi. İlkokulu memleketinde bitirirken, lise eğitimini tamamlamak için Konya Lisesi’ne gitti. Üniversite imtihanlarını kazanan Müftüoğlu, 9 Eylül Üniversitesi Mimarlık Fakültesi Kent ve Bölge Planlama Bölümü’nü kazandı ve buradan mezun oldu.
Kuddusi Müftüoğlu, hakem olarak birinci maçına 1992 yılında çıkarken, Türkiye Üstün Lig’de birinci müsabakasına 2000-2001 döneminin 11. haftasında Denizlispor-İstanbulspor maçında çıktı. 5 yıl boyunca FIFA hakemliği yaptı. 12 Ocak 2014 tarihinde Alanyaspor ile Fenerbahçe ortasında oynanan hazırlık maçıyla birlikte hakemlik mesleğine son verdi. 11 Temmuz 2015 de Merkez Hakem Heyeti Lideri oldu.